Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC1Q15915 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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