Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP1Q15431 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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