Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RAB35Q15286 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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RAB35Q15286 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB35Q15286 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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