Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
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