Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
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