Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOFQ13790 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOFQ13790 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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APOFQ13790 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOFQ13790 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
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APOFQ13790 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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