Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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