Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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