Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF4BQ13523 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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