Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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