Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
GRIN2BQ13224 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
GRIN2BQ13224 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2BQ13224 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
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