Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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