Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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LMAN2Q12907 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LMAN2Q12907 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LMAN2Q12907 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LMAN2Q12907 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LMAN2Q12907 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LMAN2Q12907 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LMAN2Q12907 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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LMAN2Q12907 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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LMAN2Q12907 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LMAN2Q12907 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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