Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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RAB40BQ12829 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RAB40BQ12829 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RAB40BQ12829 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RAB40BQ12829 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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RAB40BQ12829 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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RAB40BQ12829 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB40BQ12829 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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