Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWF1Q12792 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWF1Q12792 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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