Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms