Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf54Q08AI8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms