Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA3Q08378 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms