Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms