Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FMODQ06828 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FMODQ06828 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FMODQ06828 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FMODQ06828 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms