Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms