Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABPAQ06546 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABPAQ06546 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms