Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1T1Q06455 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms