Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN7AQ01118 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms