Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDM2Q00987 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms