Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO4P98177 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms