Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11AP62491 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms