Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP25P60880 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms