Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP4BP1P59074 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP4BP1P59074 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms