Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA9P57773 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA9P57773 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA9P57773 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA9P57773 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA9P57773 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA9P57773 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA9P57773 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms