Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB38P57729 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB38P57729 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB38P57729 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms