Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD4P55036 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD4P55036 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms