Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNQ1P51787 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNQ1P51787 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms