Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA4P51532 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms