Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DAP3P51398 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms