Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK8P49336 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK8P49336 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK8P49336 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK8P49336 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK8P49336 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms