Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms