Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC26A3P40879 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms