Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BMI1P35226 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BMI1P35226 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BMI1P35226 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BMI1P35226 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BMI1P35226 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BMI1P35226 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BMI1P35226 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BMI1P35226 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BMI1P35226 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BMI1P35226 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BMI1P35226 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BMI1P35226 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms