Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTX2P32243 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTX2P32243 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms