Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E2P29084 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms