Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC5P28715 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms