Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DNMT1P26358 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT1P26358 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms