Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2AP24928 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms