Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms