Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPREP23469 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPREP23469 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPREP23469 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPREP23469 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPREP23469 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPREP23469 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPREP23469 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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