Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA6P23229 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms