Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms