Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNB1P20700 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms