Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms